Официальную историю учебное заведение отсчитывает от 14 ноября 1930 года, когда приказом ОГПУ № 386/180 в Новом Петергофе Ленинградской области была основана "Первая школа пограничной охраны и войск ОГПУ". За долгую историю школа сменила несколько названий.

В Великую Отечественную Войну во второй половине августа 1941 года курсанты двух батальонов Ново-Петергофского военно-политического училища пограничных и внутренних войск НКВД имени К. Е. Ворошилова ценою собственных жизней смогли приостановить под Красногвардейском (ныне Гатчиной) прорыв трех германских танковых дивизий к Ленинграду. Пятьдесят дней немногие оставшиеся в живых курсанты и преподаватели училища находились в непрерывных боях, защищая Ленинград.

Их героизм был отмечен высокой государственной наградой: 10 февраля 1943 года указом Президиума Верховного Совета СССР за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте, мужество, стойкость и отвагу в борьбе с немецко-фашистскими захватчиками училище было награждено орденом Красного Знамени. Среди выпускников училища есть несколько Героев Советского Союза.

В апреле 1942 года учебное заведение передислоцировано в Саратов, где в послевоенные годы продолжилась подготовка офицеров-политработников для войск НКВД.

25 декабря 1953 года на основании приказа МВД СССР № 01173 училище было расформировано.

Воссоздание
3 октября 1967 года Совет Министров СССР принял постановление о создании Высшего пограничного военно-политического училища, для которого были построены учебные корпуса и военный городок в Голицыно под Москвой. С 5 апреля 1972 года по приказу председателя КГБ учебное заведение стало именоваться Высшим пограничным военно-политическим Краснознамённым училищем КГБ при Совете министров СССР имени К. Е. Ворошилова, тогда же оно было признано преемником Ново-Петергофского военно-политического училища пограничных и внутренних войск НКВД им. К. Е. Ворошилова, с передачей ему ордена Красного Знамени и имени К. Е. Ворошилова из наименования последнего.

По мере развития училища при нём начали функционировать школа прапорщиков, курсы усовершенствования офицерского состава, спецфакультет по подготовке кадров для социалистических стран (Куба, Монголия и другие)

Указом Президиума Верховного Совета СССР от 23 октября 1980 года за успехи в подготовке кадров училище было награждено орденом Октябрьской Революции.

В соответствии с распоряжением Президента СССР № 2781 от 24 октября 1991 года на основании приказа председателя КГБ СССР Высшее пограничное военно-политическое ордена Октябрьской Революции Краснознамённое училище КГБ СССР преобразовано в Высшее пограничное ордена Октябрьской Революции Краснознамённое училище КГБ СССР.

5 мая 1993 года согласно Постановлению № 421 Совета Министров РФ Высшее пограничное училище было преобразовано в военный институт пограничных войск РФ, позднее переименовано в Голицынский военный институт Федеральной пограничной службы РФ.